Questo lavoro di gruppo richiede di effettuare una metanalisi su un dataset che raccoglie diversi studi di efficacia della psicoterapia cognitivo-comportamentale per i disturbi d’ansia. In questo caso per una tipologia specifica di disturbi d’ansia ovvero l’ansia sociale.
Ansia sociale (o fobia sociale) è un disturbo d’ansia caratterizzato da una paura intensa e persistente di essere giudicati negativamente o di sentirsi in imbarazzo in situazioni sociali o prestazionali. Le persone con ansia sociale tendono a evitare queste situazioni o le affrontano con notevole disagio, compromettendo la qualità della vita e il funzionamento quotidiano (American Psychiatric Association, 2013).
Il dataset si trova nella repository principale del corso dentro la cartella teamworks/03-meta-analysis/social-anxiety-psychotherapy.csv.
dat <-read.csv("social-anxiety-psychotherapy.csv")head(dat)
id paper g se year n recruitment format
1 1 Abramowitz, 2009 0.54 0.39 2009 21 Community Guided Self-Help
2 2 Anderson, 2013 0.73 0.23 2013 67 Community Group Therapy
3 3 Anderson, 2013 0.64 0.24 2013 58 Community Mixed
4 4 Andersson, 2006 0.64 0.21 2006 64 Community Mixed
5 5 Andersson, 2012 0.73 0.12 2012 204 Community Guided Self-Help
6 6 Beidel, 2014 1.11 0.25 2014 60 Other Individual
intervention_type control_type p_women sessions country
1 Cognitive Behavior Therapy Waitlist 76% 8 North America
2 Cognitive Behavior Therapy Waitlist 62% 8 North America
3 Cognitive Behavior Therapy Waitlist 62% 8 North America
4 Cognitive Behavior Therapy Waitlist 52% 11 Europe
5 Cognitive Behavior Therapy Waitlist 60% 9 Europe
6 Exposure Waitlist 52% 24 North America
age_group mean_age risk_bias
1 Adults 43 Some concerns
2 Adults 39 High
3 Adults 39 High
4 Adults 37 Some concerns
5 Adults 38 Some concerns
6 Adults 36 High
Le variabili sono le seguenti:
id: identificativo dell’effetto
paper: identificativo del paper
g: effect size (Hedges’s \(g\))
se: effect size standard error
year: anno di pubblicazione
n: sample size
recruitement: luogo di reclutamente dei pazienti/controlli
format: modalità di psicoterapia
intervention_type: tipo di psicoterapia
control_tupe: tipologia di gruppo di controllo
p_women: percentuale di donne nel campione
sessions: numero di sessioni di psicoterapia
country: dove è stato eseguito lo studio
age_group: categoria d’età
mean_age: età media del campione
risk_bias: livello di rischio che quello studio abbia delle problematiche che potrebbero influenzare i risultati
Steps
Gli step da eseguire sono i seguenti:
descrizione dettagliata del dataset in modo discorsivo con statistiche descrittive e grafici adeguati ad ogni tipo di variabile
effettuare la metanalisi usando diversi modelli e confrontando i risultati.
modello a due livelli random-effects e fixed-effects
modello a due livelli random-effects e fixed-effects aggregando gli effetti nello stesso paper. Si veda il capitolo borenstein-aggregation.pdf ed implementare manualmente la formula adeguata.
modello a tre livelli per gestire la struttura nested dei dati
valutare e commentare l’effetto dei moderatori e se possibile della loro interazione sia per il modello a due livelli che quello a tre livelli
valutare il publication bias usando tutti i metodi che sono stati presentati a lezione. Per quanto riguarda i selection models scegliere almeno 3 modelli diversi e confrontare i risultati.
produrre grafici e tabelle per ogni risultato. in particolare:
riprodurre i forest plot e funnel plot usando ggplot2 (senza usare pacchetti aggiuntivi) che siano più simili possibili a quelli di metafor
produrre dei grafici per l’effetto dei moderatori che rappresentino i risultati in modo adeguato
produrre delle tabelle che rappresentino i risultati in modo adeguato. Utilizzare il pacchetto e la modalità che si preferisce.
implementare senza utilizzare pacchetti aggiuntivi un test di permutazione per il modello random-effects a due livelli per l’effetto generale
valutare per il modello a due livelli random-effects (senza aggregare) l’impatto dei singoli paper con una leave-one-out analysis con relativa rappresentazione grafica
Aspetti generali
Ogni step deve essere accompagnato da una spiegazione narrativa e dove pertinente da rappresentazioni grafiche e tabelle che spieghino in maniera chiara i risultati
Tutti gli step devono essere prodotti in un documento Quarto (html o pdf) riproducibile e self-contained
Chi vuole può preparare una presentazione in Quarto da utilizzare durante l’esame