Introduzione a R Markdown

class: center, middle, inverse, title-slide

# Introduzione a R Markdown
## <br/>Create amazing documents with R
### Filippo Gambarota
### Università di Padova

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# Making documents...

Se dovete scrivere qualcosa (un report, una tesi, un documento generico) cosa vi viene in mente di utilizzare?

Probabilmente **Microsoft Word** oppure **Google Docs**. Sono ottimi software, molto *intuitivi*, *facili da imparare* e *estramamente popolari*.

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# The ~~pain~~ joy of making documents

Sicuramente però vi sarà capitato di dover fare operazioni complesse come:

- gestire documenti con molte pagine
- inserire (o modificare 😱) figure e tabelle
- gestire bibliografia
- numerare paragrafi, tabelle e immagini

.pull-left[

]

.pull-right[

]

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# Why?

I programmi come Microsoft Word e affini sono definiti WYSIWYG (**W**hat **Y**ou **S**ee **I**s **W**hat **Y**ou **G**et) perchè quello che vediamo mentre scriviamo è esattamente il risultato finale:

- se vogliamo mettere **grassetto** usiamo `ctrl + b` oppure clicchiamo un pulsante e vediamo subito il risultato
- se vogliamo inserire un'immagine trasciniamo il file e la spostiamo millimetro per millimetro manualmente

Questo ha il vantaggio di essere molto intuitivo e semplice, ma ci sono diversi svantaggi:

- non abbiamo (quasi) mai una **visione d'insieme del documento** (sposto l'immagine e non so cosa succede)
- pensiamo **contemporaneamente** al testo e alla formattazione
- versioni di Word (o equivalenti) diverse possono creare **problemi di compatibilità**
- quando il documento diventa pesante (> 30 pagine) ci possono essere **problemi di performance e formattazione**

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# Ok.. qualche alternativa?

L'approccio alternativo è caratterizzato da **separare la formattazione e impaginazione (tedioso, complicato e superfluo) dal contenuto effettivo** in termini di testo.

Questo è possibile utilizzando **linguaggi di markup** ovvero un modo di scrivere del testo che viene **intepretato e compilato** e permette di produrre un certo tipo di risultato. Ad esempio:

.pull-left[

```html
<!DOCTYPE html>
<html>
<body>

<h1>My First Heading</h1>

<p>My first paragraph.</p>

</body>
</html>
```

]

.pull-right[

```latex
\documentclass[12pt]{article}
\usepackage{lingmacros}
\usepackage{tree-dvips}
\begin{document}

\section*{Notes for My Paper}

Don't forget to include examples of topicalization.
They look like this:

\subsection*{How to handle topicalization}

I'll just assume a tree structure like (\ex{1}).

```

]

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# HTML

Questo è un esempio per scrivere un testo in html:

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# Latex

Questo è lo stesso esempio ma in Latex:

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# Ma cosa centra tutto questo con R?

Per documenti semplici effettivamente non è necessario imparare un linguaggio come `HTML` o `Latex`. Pensate però ad una tesi di laurea, ad un report di analisi o un documento scientifico in generale dove:

- **inserire statistiche** con un certo stile di formattazione
- **modificare** diversi numeri se ci sono cambiamenti nelle analisi
- **aggiornare** figure e tabelle se vengono modificate

Sarebbe fantastico poter unire codice (i.e., la creazione di figure/tabelle) con il testo in un unico documento!

## Questo in programmazione si chiama **Literate Programming**

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# Un esempio?

Immaginate di scrivere un report per un'analisi che avete fatto in R e vogliate inserire questo grafico:

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# In word...

.pull-left[

In word dovreste:

- creare il documento e scrivere tutta la parte di testo
- inserire l'immagine da un file esterno
- riposizionare e ridimensionare l'immagine, scrivere la caption

Cosa succede se l'immagine cambia? Dovete manualmente eliminare l'immagine precedente e inserire la nuova immagine. E cosa succede se 10 grafici che avete inserito sono da cambiare? (😱)
]

.pull-right[

]

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# Un esempio?

Nel **literate programming** invece l'idea è che un certo elemento (ad esempio un grafico) viene creato con un pezzo di codice che verrà intepretato.

Questo è il codice per produrre il grafico:

```r
mtcars %>% 
  ggplot(aes(x = mpg, y = disp)) +
  geom_point(size = 3) +
  geom_smooth(method = "lm") +
  cowplot::theme_minimal_grid(font_size = 20)
```

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# Un esempio?

.pull-left[

.markdown[

```
... testo

mtcars %>% 
  ggplot(aes(x = mpg, y = disp)) +
  geom_point(size = 3) +
  geom_smooth(method = "lm") +
  cowplot::theme_minimal_grid(font_size = 20)

... ancora testo

```
]

]

.pull-right[

... testo

<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="rmarkdown-intro_files/figure-html/unnamed-chunk-9-1.png" alt="Figure 1. Awesome figure!" width="70%" />
<p class="caption">Figure 1. Awesome figure!</p>
</div>

... ancora testo

]

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# Literate programming (LP) in R?

Come abbiamo visto, per utilizzare LP abbiamo bisogno di un linguaggio di **markup** (HTML, Latex, etc.) e ovviamente di un linguaggio di programmazione.

Tra tutti i linguaggi di markup, uno in particolare è emerso recentemente per semplicità, facilità di lettura e si apprende in circa 30 minuti: Il linguaggio [**Markdown**](https://www.markdownguide.org/basic-syntax/).

.pull-left[

]

.pull-right[

## Vediamo un esempio! https://dillinger.io/
(BTW queste stesse slide sono scritte in Markdown! 🤭)

]

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# R Markdown

R Markdown è la fusione dei linguaggi Markdown e R per poter creare documenti, slide, siti web, curriculum, tesi, articoli scientifici `combinando codice e testo`.

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# Perchè R Markdown?

Scrivendo in `HTML` possiamo principalmente scrivere documenti `HTML` (visualizzabili con un browser web). Scrivendo in Latex possiamo creare principalmente documenti `PDF`. Il linguaggio Markdown può essere usato per produrre qualsiasi tipo di documento<sup>1</sup>:

.footnote[
[R Markdown Cookbook](https://bookdown.org/yihui/rmarkdown-cookbook/rmarkdown-process.html)
]

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# Un documento dinamico

Un documento R Markdown è **dinamico** perchè un cambiamento nel testo, nei dati o nel codice automaticamente aggiorna l'output essendo che **figure, tabelle e numeri sono generati durante la compilazione**

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# The Big Picture

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# YAML Header

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# YAML Header

All'inizo di ogni documento RMarkdown è presente una sezione (YAML header) dove indicare le impostazioni generali del documento:

```
---
title: "Document Title"
author: "Autore"
date: "2/18/2022"
output: html_document
---

```

Ci sono tantissime opzioni che dipendono:

- dal tipo di documento (presentazione, report, tesi, etc.)
- dal tipo di output (html, pdf, word, etc.)

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# YAML Header

L'unica cosa importante è scrivere questa sezione in modo corretto. Lo `YAML` è un linguaggio di markup intpretato come codice e richiede delle regole:

- `argomento: valore`
- indendazione corretta (spazi, a capo)
- argomenti corretti (esempio `output: html-document` è sbagliato, vi darà errore)

In generale lo `YAML` equivale alle impostazioni di un normale documento word che controlla i vari metadati, struttura, etc.
La maggior parte delle volte non dovete scrivere questa sezione manualmente o comunque ci sono diversi template dove al massimo aggiustare alcune parti.

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# Body

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# Body - Testo

Il corpo del documento è la parte principaleche viene intesa come **testo** letteralmente. In questo caso dobbiamo scrivere (utilizzando un linguaggio di markup) quello che vogliamo sia visualizzato nel risultato finale:

.markdown[

```
---
title: "Document Title"
author: "Autore"
date: "2/18/2022"
output: html_document
---

# Heading 1

Questo è il mio primo documento in **RMarkdown**.

Effettivamente all'inizio è un *pochino strano* non visualizzare subito il risultato 
finale ma i vantaggi sono tantissimi! Aspettate di vedere quando useremo il `codice`.

## Heading 2

Vi renderete conto, dopo averlo utilizzato un pochino, che è facile da leggere e scrivere
anche se non è esattamente immediato come un documento word.

```
]

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# Body - Codice

Ci sono due tipi di codice che potete inserire in un documento RMarkdown:

- **code chunks**
- `inline code`

La differenza è che i code chunks sono operazioni più complesse che sono chiaramente distinte dal testo mentre gli inline code sono parte integrante del testo.

.pull-left[

````
```{r, eval=TRUE}
print(1:5)
```
````

```
## [1] 1 2 3 4 5
```

]

.pull-right[

Questo invece è un inline-code. Se voglio scrivere il numero `10` posso fare anche in questo modo: scrivo il numero `10`. Non si vede direttamente dalle slide ma io non ho scritto *verbatim* il numero 10 ma è il risultato di <code>&grave;r 5+5&grave;</code>

]

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# Codice - Chunks

Vediamo più nel dettaglio come è composto un chunk di codice:

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# Codice - Inline

Il formato dell'inline invece è più semplice, si utilizzano i backticks <code>&grave;r codice&grave;</code>. L'espressione viene quindi intepretata come codice ed il risultato viene inserito all'interno del testo. Immaginiamo di avere un oggetto R salvato nell'ambiente principale:

```
##  [1] -0.7068766 -1.7352091  0.6627869  0.9603524  0.2116784 -0.3300235  0.1607794 -0.7165689 -0.7908567
## [10]  1.3689565
```

Se durante il testo vogliamo fare riferimento all'oggetto `x` possiamo riportare caratteristiche di `x` senza esplicitamente scrivere i numeri:

- La media di `x` è <code>&grave;r mean(x)&grave;</code> -> -0.0914981
- La deviazione standard di `x` è <code>&grave;r sd(x)&grave;</code> -> 0.9416894
- L'errore standard della media di `x` è <code>&grave;r sd(x)/sqrt(length(x))&grave;</code> -> 0.2977883

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# Espressioni Matematiche
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# Espressioni Matematiche

Qualche volta dobbiamo scrivere espressioni matematiche `$\frac{x}{2}$`, lettere greche `$\mu_x$` o espressioni complesse `$y_i = \beta_0 + \beta_{1}X_{1} + \epsilon_i$`. In word queste sono estremamente complesse da scrivere mentre in RMarkdown è sufficiente imparare la sintassi di Latex:

- `$\frac{x}{2}$` -> `$\frac{x}{2}$`
- `$y_i = \beta_0 + \beta_{1}X_{1}$ + \epsilon_i$`->  `$y_i = \beta_0 + \beta_{1}X_{1} + \epsilon_i$`

Qualche tutorial su come scrivere formule e simboli in RMarkdown:

- https://rpruim.github.io/s341/S19/from-class/MathinRmd.html
- https://rmd4sci.njtierney.com/math

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# Immagini
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# Codice - Immagini

Per inserire immagini possiamo utilizzare la **sintassi markdown** oppure **codice R**:

.pull-left[
</br>

`![](img/ex-img1.png)`
![](img/ex-img1.png)

]

.pull-right[

````
```{r, fig.cap = "The caption of my image"}
knitr::include_graphics("img/ex-img2.png")
```
````
<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="img/ex-img2.jpg" alt="The caption of my image" width="328" />
<p class="caption">The caption of my image</p>
</div>

]

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# Tabelle

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# Tabelle

Le tabelle sono un pochino più complicate da creare completamente a mano (anche se ci sono [soluzioni](https://www.tablesgenerator.com/markdown_tables) più automatiche). La sintassi Markdown è la seguente:

```markdown
| Colonna1 | Colonna2 | Colonna3 |
|----------|----------|----------|
| 1        | 4        | 7        |
| 2        | 5        | 8        |
| 3        | 6        | 9        |
```

Crea questa tabella:

| Colonna1 | Colonna2 | Colonna3 |
|----------|----------|----------|
| 1        | 4        | 7        |
| 2        | 5        | 8        |
| 3        | 6        | 9        |

---
# Tabelle

Solitamente però le tabelle sono: **statistiche descrittive** o **risultati di modelli statistici**. In questo caso crearle è estramamente semplice ed efficiente con alcuni pacchetti R basandosi su `modelli` salvati come oggetto o da `dataframe`:

```
## # A tibble: 3 x 6
##   Species     mean    sd     se   min   max
##   <fct>      <dbl> <dbl>  <dbl> <dbl> <dbl>
## 1 setosa      5.01 0.352 0.0498   4.3   5.8
## 2 versicolor  5.94 0.516 0.0730   4.9   7  
## 3 virginica   6.59 0.636 0.0899   4.9   7.9
```

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# Tabelle

```r
library(kableExtra)

iris_summ %>% 
  kable() %>% 
  kable_styling(bootstrap_options = c("condensed", "striped"),
                full_width = FALSE)
```

<table class="table table-condensed table-striped" style="width: auto !important; margin-left: auto; margin-right: auto;">
 <thead>
  <tr>
   <th style="text-align:left;"> Species </th>
   <th style="text-align:right;"> mean </th>
   <th style="text-align:right;"> sd </th>
   <th style="text-align:right;"> se </th>
   <th style="text-align:right;"> min </th>
   <th style="text-align:right;"> max </th>
  </tr>
 </thead>
<tbody>
  <tr>
   <td style="text-align:left;"> setosa </td>
   <td style="text-align:right;"> 5.006 </td>
   <td style="text-align:right;"> 0.3524897 </td>
   <td style="text-align:right;"> 0.0498496 </td>
   <td style="text-align:right;"> 4.3 </td>
   <td style="text-align:right;"> 5.8 </td>
  </tr>
  <tr>
   <td style="text-align:left;"> versicolor </td>
   <td style="text-align:right;"> 5.936 </td>
   <td style="text-align:right;"> 0.5161711 </td>
   <td style="text-align:right;"> 0.0729976 </td>
   <td style="text-align:right;"> 4.9 </td>
   <td style="text-align:right;"> 7.0 </td>
  </tr>
  <tr>
   <td style="text-align:left;"> virginica </td>
   <td style="text-align:right;"> 6.588 </td>
   <td style="text-align:right;"> 0.6358796 </td>
   <td style="text-align:right;"> 0.0899270 </td>
   <td style="text-align:right;"> 4.9 </td>
   <td style="text-align:right;"> 7.9 </td>
  </tr>
</tbody>
</table>

---

# Tabelle

Ci sono alcuni pacchetti (e.g., `sjplot`) che partendo da un modello fittato in R creano una tabella pronta per essere messa in un paper o nella tesi:

```r
library(sjPlot)
sjPlot::tab_model(fit)
```

<table style="border-collapse:collapse; border:none;">
<tr>
<th style="border-top: double; text-align:center; font-style:normal; font-weight:bold; padding:0.2cm;  text-align:left; ">&nbsp;</th>
<th colspan="3" style="border-top: double; text-align:center; font-style:normal; font-weight:bold; padding:0.2cm; ">mpg</th>
</tr>
<tr>
<td style=" text-align:center; border-bottom:1px solid; font-style:italic; font-weight:normal;  text-align:left; ">Predictors</td>
<td style=" text-align:center; border-bottom:1px solid; font-style:italic; font-weight:normal;  ">Estimates</td>
<td style=" text-align:center; border-bottom:1px solid; font-style:italic; font-weight:normal;  ">CI</td>
<td style=" text-align:center; border-bottom:1px solid; font-style:italic; font-weight:normal;  ">p</td>
</tr>
<tr>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:left; ">(Intercept)</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">19.20</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">&#45;7.62&nbsp;&ndash;&nbsp;46.02</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">0.154</td>
</tr>
<tr>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:left; ">disp</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">&#45;0.04</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">&#45;0.05&nbsp;&ndash;&nbsp;-0.02</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  "><strong>&lt;0.001</strong></td>
</tr>
<tr>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:left; ">qsec</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">0.38</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">&#45;0.58&nbsp;&ndash;&nbsp;1.33</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">0.427</td>
</tr>
<tr>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:left; ">gear</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">0.71</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">&#45;1.80&nbsp;&ndash;&nbsp;3.21</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:center;  ">0.567</td>
</tr>
<tr>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:left; padding-top:0.1cm; padding-bottom:0.1cm; border-top:1px solid;">Observations</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; padding-top:0.1cm; padding-bottom:0.1cm; text-align:left; border-top:1px solid;" colspan="3">32</td>
</tr>
<tr>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; text-align:left; padding-top:0.1cm; padding-bottom:0.1cm;">R<sup>2</sup> / R<sup>2</sup> adjusted</td>
<td style=" padding:0.2cm; text-align:left; vertical-align:top; padding-top:0.1cm; padding-bottom:0.1cm; text-align:left;" colspan="3">0.725 / 0.695</td>
</tr>

</table>

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class: inverse, center, middle

# Gestire Bibliografia?
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# Gestire Bibliografia

Anche la gestione della bibliografia è estremamente semplice. L'idea è di avere un file `.bib` con tutti i riferimenti che vogliamo citare. I file bib possono essere generati dai vari software per gestire la bibliografia (Mendeley, Zotero, etc.) oppure direttamente dai database (Google Scholar):

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# Gestire Bibliografia

Poi trovate questo, che estrae le informazioni rilevanti in un formato (`.bib`) leggibile da R

```
@article{vogel2004,
  title={Neural activity predicts individual differences in visual working memory capacity},
  author={Vogel, Edward K and Machizawa, Maro G},
  journal={Nature},
  volume={428},
  number={6984},
  pages={748--751},
  year={2004},
  publisher={Nature Publishing Group}
}
```

---

# Gestire Bibliografia

Aggiornando lo `YAML` con il percorso del file `.bib` ed eventualmente un file `.csl` (che definisce lo stile della bibligrafia, e.g., APA 7th):

```
---
title: "Document Title"
author: "Autore"
date: "2/18/2022"
output: html_document
*bibliography: files/references.bib
*csl: files/apa7.csl
---

```

Poi potete durante la scrittura inserire una citazione inline `[@vogel2004]` e questa verrà inserita come citazione inline (Vogel & Machizawa, 2004) e come citazione alla fine in termini voce bibliografica completa:

- Vogel, E. K., & Machizawa, M. G. (2004). Neural activity predicts individual differences in visual working memory capacity. *Nature*, 428(6984), 748-751.

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class: inverse, center, middle

# Come organizzare un documento

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# Come organizzare un documento

Solitamente siamo abituati ad avere un unico documento, ad esempio `documento.docx` che contiene tutto. Quando lavoriamo con R Markdown dobbiamo organizzarci in modo diverso:

.pull-left[

```
  📦rmarkdown
   ┣ 📂files
   ┃ ┣ 📜apa7.cls
   ┃ ┗ 📜references.bib
   ┣ 📂img
   ┃ ┗ 📜img1.png
*  ┣ 📜document.Rmd
   ┣ 📜document.html
   ┣ 📜document.pdf
   ┗ 📜document.word
```
]

.pull-rigth[

Esiste il file `.Rmd` e tutti i file secondari (immagini, bibliografia, etc.). Il file `.Rmd` viene compilato per creare poi i vari output (`.html`, `.pdf`, `.word`, etc.)

]

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# Altre cose che posso fare?

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# Altre cose che posso fare?

- Slides (queste slides sono fatte in RMarkdown)
  - [Xaringan](https://github.com/yihui/xaringan)
- Curriculum (ci sono dei template)
  - [Vitae](https://github.com/mitchelloharawild/vitae)
  - [Pagedown](https://github.com/rstudio/pagedown)
- Libri
  - [Bookdown](https://pkgs.rstudio.com/bookdown/)
- Siti web
  - [Blogdown](https://pkgs.rstudio.com/blogdown/)
  - [Distill](https://rstudio.github.io/distill/)

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class: inverse, center, middle

# Qualche consiglio finale

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# Qualche consiglio finale

Le potenzialità di RMarkdown sono immense ma anche la curva di apprendimento è notevole, sopratutto di funzioni più avanzate. Quindi:

- Trovate un **template** per le vostre esigenze (report, tesi), scrivendo `rmarkdown template` su Google
- Se avete necessità, modificate alcune parti del template in modo da capire anche le funzionalità più avanzate
- Non preoccupatevi più di:
  - copiare e incollare numeri, statistiche e risultati
  - spostare manualmente tabelle e immagini
  - gestire a mano la bibliografia
  
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# Resources

Tutto il materiale che riguarda l'introduzione a R Markdown si trova nella repository <svg viewBox="0 0 496 512" style="height:1em;position:relative;display:inline-block;top:.1em;" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg">  <path d="M165.9 397.4c0 2-2.3 3.6-5.2 3.6-3.3.3-5.6-1.3-5.6-3.6 0-2 2.3-3.6 5.2-3.6 3-.3 5.6 1.3 5.6 3.6zm-31.1-4.5c-.7 2 1.3 4.3 4.3 4.9 2.6 1 5.6 0 6.2-2s-1.3-4.3-4.3-5.2c-2.6-.7-5.5.3-6.2 2.3zm44.2-1.7c-2.9.7-4.9 2.6-4.6 4.9.3 2 2.9 3.3 5.9 2.6 2.9-.7 4.9-2.6 4.6-4.6-.3-1.9-3-3.2-5.9-2.9zM244.8 8C106.1 8 0 113.3 0 252c0 110.9 69.8 205.8 169.5 239.2 12.8 2.3 17.3-5.6 17.3-12.1 0-6.2-.3-40.4-.3-61.4 0 0-70 15-84.7-29.8 0 0-11.4-29.1-27.8-36.6 0 0-22.9-15.7 1.6-15.4 0 0 24.9 2 38.6 25.8 21.9 38.6 58.6 27.5 72.9 20.9 2.3-16 8.8-27.1 16-33.7-55.9-6.2-112.3-14.3-112.3-110.5 0-27.5 7.6-41.3 23.6-58.9-2.6-6.5-11.1-33.3 2.6-67.9 20.9-6.5 69 27 69 27 20-5.6 41.5-8.5 62.8-8.5s42.8 2.9 62.8 8.5c0 0 48.1-33.6 69-27 13.7 34.7 5.2 61.4 2.6 67.9 16 17.7 25.8 31.5 25.8 58.9 0 96.5-58.9 104.2-114.8 110.5 9.2 7.9 17 22.9 17 46.4 0 33.7-.3 75.4-.3 83.6 0 6.5 4.6 14.4 17.3 12.1C428.2 457.8 496 362.9 496 252 496 113.3 383.5 8 244.8 8zM97.2 352.9c-1.3 1-1 3.3.7 5.2 1.6 1.6 3.9 2.3 5.2 1 1.3-1 1-3.3-.7-5.2-1.6-1.6-3.9-2.3-5.2-1zm-10.8-8.1c-.7 1.3.3 2.9 2.3 3.9 1.6 1 3.6.7 4.3-.7.7-1.3-.3-2.9-2.3-3.9-2-.6-3.6-.3-4.3.7zm32.4 35.6c-1.6 1.3-1 4.3 1.3 6.2 2.3 2.3 5.2 2.6 6.5 1 1.3-1.3.7-4.3-1.3-6.2-2.2-2.3-5.2-2.6-6.5-1zm-11.4-14.7c-1.6 1-1.6 3.6 0 5.9 1.6 2.3 4.3 3.3 5.6 2.3 1.6-1.3 1.6-3.9 0-6.2-1.4-2.3-4-3.3-5.6-2z"></path></svg> [rmarkdown-intro](filippogambarota.github.io/rmarkdown-intro). Potete accedere direttamente al [sito](https://filippogambarota.github.io/rmarkdown-intro/) Dove trovate:

- il codice per riprodurre queste slide
- i template di documenti, slide ed esercizi
- alcuni riferimenti come libri, tutorial e siti utili

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# Some extras...

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# Trackdown

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Vi segnalo **Trackdown**, un pacchetto R creato e mantenuto da [Claudio Zandonella Callegher](https://github.com/ClaudioZandonella/trackdown) al quale ho partecipato anche io.

Il pacchetto vi permette di lavorare su documenti R Markdown in modo collaborativo usando Google Docs. Se volete saperne di più è disponibile un [video](https://www.powtoon.com/embed/bWtc2qqbZ5F/) introduttivo

]

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# Per approfondire...

Se volete ulteriormente approfondire, il Dipartimento di Psicologia dello Sviluppo e della Socializzazione sta organizzando dei corsi avanzati su argomenti utili nella ricerca (**Applied Research Courses Academy**, [ARCA](https://www.dpss.unipd.it/arca/home))

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In particolare, la Dott.ssa **Ottavia Epifania** tiene un corso approfondito su R Markdown https://www.dpss.unipd.it/arca/RMarkdown

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# Are you ready to create amazing documents? 😄

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.contact[<svg viewBox="0 0 512 512" style="height:1em;position:relative;display:inline-block;top:.1em;" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg">  <path d="M464 64H48C21.49 64 0 85.49 0 112v288c0 26.51 21.49 48 48 48h416c26.51 0 48-21.49 48-48V112c0-26.51-21.49-48-48-48zm0 48v40.805c-22.422 18.259-58.168 46.651-134.587 106.49-16.841 13.247-50.201 45.072-73.413 44.701-23.208.375-56.579-31.459-73.413-44.701C106.18 199.465 70.425 171.067 48 152.805V112h416zM48 400V214.398c22.914 18.251 55.409 43.862 104.938 82.646 21.857 17.205 60.134 55.186 103.062 54.955 42.717.231 80.509-37.199 103.053-54.947 49.528-38.783 82.032-64.401 104.947-82.653V400H48z"></path></svg> **filippo.gambarota@gmail.com**]
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.contact[<svg viewBox="0 0 512 512" style="height:1em;position:relative;display:inline-block;top:.1em;" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg">  <path d="M459.37 151.716c.325 4.548.325 9.097.325 13.645 0 138.72-105.583 298.558-298.558 298.558-59.452 0-114.68-17.219-161.137-47.106 8.447.974 16.568 1.299 25.34 1.299 49.055 0 94.213-16.568 130.274-44.832-46.132-.975-84.792-31.188-98.112-72.772 6.498.974 12.995 1.624 19.818 1.624 9.421 0 18.843-1.3 27.614-3.573-48.081-9.747-84.143-51.98-84.143-102.985v-1.299c13.969 7.797 30.214 12.67 47.431 13.319-28.264-18.843-46.781-51.005-46.781-87.391 0-19.492 5.197-37.36 14.294-52.954 51.655 63.675 129.3 105.258 216.365 109.807-1.624-7.797-2.599-15.918-2.599-24.04 0-57.828 46.782-104.934 104.934-104.934 30.213 0 57.502 12.67 76.67 33.137 23.715-4.548 46.456-13.32 66.599-25.34-7.798 24.366-24.366 44.833-46.132 57.827 21.117-2.273 41.584-8.122 60.426-16.243-14.292 20.791-32.161 39.308-52.628 54.253z"></path></svg> **@fgambarota**]
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.contact[<svg viewBox="0 0 496 512" style="height:1em;position:relative;display:inline-block;top:.1em;" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg">  <path d="M165.9 397.4c0 2-2.3 3.6-5.2 3.6-3.3.3-5.6-1.3-5.6-3.6 0-2 2.3-3.6 5.2-3.6 3-.3 5.6 1.3 5.6 3.6zm-31.1-4.5c-.7 2 1.3 4.3 4.3 4.9 2.6 1 5.6 0 6.2-2s-1.3-4.3-4.3-5.2c-2.6-.7-5.5.3-6.2 2.3zm44.2-1.7c-2.9.7-4.9 2.6-4.6 4.9.3 2 2.9 3.3 5.9 2.6 2.9-.7 4.9-2.6 4.6-4.6-.3-1.9-3-3.2-5.9-2.9zM244.8 8C106.1 8 0 113.3 0 252c0 110.9 69.8 205.8 169.5 239.2 12.8 2.3 17.3-5.6 17.3-12.1 0-6.2-.3-40.4-.3-61.4 0 0-70 15-84.7-29.8 0 0-11.4-29.1-27.8-36.6 0 0-22.9-15.7 1.6-15.4 0 0 24.9 2 38.6 25.8 21.9 38.6 58.6 27.5 72.9 20.9 2.3-16 8.8-27.1 16-33.7-55.9-6.2-112.3-14.3-112.3-110.5 0-27.5 7.6-41.3 23.6-58.9-2.6-6.5-11.1-33.3 2.6-67.9 20.9-6.5 69 27 69 27 20-5.6 41.5-8.5 62.8-8.5s42.8 2.9 62.8 8.5c0 0 48.1-33.6 69-27 13.7 34.7 5.2 61.4 2.6 67.9 16 17.7 25.8 31.5 25.8 58.9 0 96.5-58.9 104.2-114.8 110.5 9.2 7.9 17 22.9 17 46.4 0 33.7-.3 75.4-.3 83.6 0 6.5 4.6 14.4 17.3 12.1C428.2 457.8 496 362.9 496 252 496 113.3 383.5 8 244.8 8zM97.2 352.9c-1.3 1-1 3.3.7 5.2 1.6 1.6 3.9 2.3 5.2 1 1.3-1 1-3.3-.7-5.2-1.6-1.6-3.9-2.3-5.2-1zm-10.8-8.1c-.7 1.3.3 2.9 2.3 3.9 1.6 1 3.6.7 4.3-.7.7-1.3-.3-2.9-2.3-3.9-2-.6-3.6-.3-4.3.7zm32.4 35.6c-1.6 1.3-1 4.3 1.3 6.2 2.3 2.3 5.2 2.6 6.5 1 1.3-1.3.7-4.3-1.3-6.2-2.2-2.3-5.2-2.6-6.5-1zm-11.4-14.7c-1.6 1-1.6 3.6 0 5.9 1.6 2.3 4.3 3.3 5.6 2.3 1.6-1.3 1.6-3.9 0-6.2-1.4-2.3-4-3.3-5.6-2z"></path></svg> **filippogambarota**]
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